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7. Juli 2017, 11.00 Uhr bis 16.30 Uhr
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Anton Link (erkrankt), Dieter Neubacher, Wolfgang Reichert (nachmittags), Veronica Sanz, Stefan Seifert, Dagmar Triebel, Tanja Weibulat (SNSB IT Center, DiversityDescriptions, SDD Data-Pipelines für GFBio, [http://www.deemy.de/ DEEMY])
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Protokoll: Tanja Weibulat
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Wegen Terminüberschneidungen organisiert Frau Gerstner ein zweites Treffen in München am 11.7., dann mit Robert Huber und Entwicklern in München.
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===Agenda===
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* ab 10.30 Uhr Eintreffen der Teilnehmer
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* 11.00 Begrüßung (D. Triebel)
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* 11.05 Uhr Demo des GFBio VAT Tools, mögliche Interoperabilität mit SDD und EML (M. Mattig, B. Seeger)
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* 11.45 Uhr Demo von DEEMY Portal mit NaviKey Applet zur Merkmalsauswahl und interaktiven Identifikation (G. Rambold, D. Triebel)
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* 12.00 Uhr DEEMY und BEF China, Beispiele für Datenmanagement in DiversityDescriptions (V. Sanz)
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* 12.15 Uhr Demo von LIAS gtm, Daten-Export als csv, Erörterung einer möglichen Datenbereitstellung der Exporte für das GFBio VAT Tool (G. Rambold)
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* 12.45 Uhr Mittagspause, Café Botanischer Garten
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* 13.30 Uhr Datenmanagement mit DiversityDescriptions, Pipelines zum Datenimport z. B. als csv, und Datenexport, Datenpublikation, SDD xml-Archive im GFBio Wiki (DEEMY html, SDD-structured xml, DELTA) (V. Sanz)
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* 14.00 Uhr Community Standard SDD und Community Standard EML (D. Triebel)
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* 14.15 Uhr Datenmanagement ökologischer Datenpakete mit Morpho; Datenbereitstellung als EML für GFBio VAT Tool mit MetaCat über SGN Webserver (T. Weibulat in Vertretung von E.-M. Gerstner)
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* 14.45 Uhr Diskussion über Möglichkeiten der Datenbereitstellung für GFBio VAT Tool über Daten-Pipelines aus DiversityProjects + DiversityDescriptions-Installationen; GFBio Datenpakete mit GFBio Submission Meta-Information nach ?? ABCD oder ?? EML oder ?? SDD-Standard als xml-Archive angeboten über SNSB Webserver? Welche Meta-Informationen braucht das VAT Tool?
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* 15.15 Uhr Kaffeepause
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* 15.45 Uhr Abschlussdiskussion und angestrebte Kooperationen, inkl. Diskussion über SDD-EML-OAI-PMH Mapping und Conversion Tools? ToDos - GFBio Phase III?
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* 16.30 Uhr Ende
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===Links===
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*[https://gfbio.biowikifarm.net/wiki/Technical_documentation_of_management_systems,_data_processing_and_publication_tools_not_specialised_on_collection_data Technische Dokumentation von DiversityDescriptions, DiversityProjects, MetaCat und Morpho im GFBio Kontext]
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*[https://gfbio.biowikifarm.net/wiki/Data_exchange_standards,_protocols_and_formats_relevant_for_the_collection_data_domain_within_the_GFBio_network Community Standards EML und SDD im GFBio Kontext]
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*[https://knb.ecoinformatics.org/#external//emlparser/docs/eml-2.1.1/eml-faq.html EML FAQs]
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*[https://knb.ecoinformatics.org/#external//emlparser/docs/eml-2.1.1/./index.html EML Specifications]
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*[http://www.deemy.de/Identification/Navikey/index.html DEEMY – NaviKey JAVA Applet]
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*[http://liaslight.lias.net/Identification/Navikey/World/en_GB/index.html LIAS – NaviKey JAVA Applet]
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*GFBio intern: [https://gfbio.biowikifarm.net/internal/GFBio_collection_archives_-_SDD_DIPs GFBio SDD DIPs als xml-Archive]
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*GFBio intern: [https://gfbio.biowikifarm.net/internal/EML_to_PanSimple_Mapping EML to PanSimple Mapping]
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*GFBio intern: [https://gfbio.biowikifarm.net/internal/Treffen_zu_EML-_bzw._SDD-strukturierten_Daten_II Treffen zu EML- bzw. SDD-strukturierten Daten II]
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===References===
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*Authmann C., Beilschmidt C., Drönner J., Mattig M. & Seeger B. (2015). VAT: A System for Visualizing, Analyzing and Transforming Spatial Data in Science. Datenbank-Spektrum 15(3): 175-184 ([http://dx.doi.org/10.1007/s13222-015-0197-y doi:10.1007/s13222-015-0197-y])
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*Rambold, G., Zedda, L., Coyle, J., Peršoh, D., Köhler, T., Triebel, D. (2016). Geographic heat maps of lichen traits derived by combining LIAS light description and GBIF occurrence data, provided on a new platform. – Biodiversity and Conservation 25(13): 2743–2751. ([http://dx.doi.org/10.1007/s10531-016-1199-2 doi:10.1007/s10531-016-1199-2])
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===Treffen zur Vorbereitung der Nomenclature Section, Shenzhen, China, August 2017===
 
===Treffen zur Vorbereitung der Nomenclature Section, Shenzhen, China, August 2017===
  
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Revision as of 11:41, 6 July 2017

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Ort

SNSB IT Center München, Menzinger Straße 67, rechter Gebäudeflügel, Parterre, Raum 035

Datum und Zeit

7. Juli 2017, 11.00 Uhr bis 16.30 Uhr

Teilnehmer

Gäste: Thomas Köhler (erkrankt), Gerhard Rambold (Universität Bayreuth, LIAS gtm, NavKey)

Michael Mattig, Bernhard Seeger (Universität Marburg, VAT-Tool)

Anton Link (erkrankt), Dieter Neubacher, Wolfgang Reichert (nachmittags), Veronica Sanz, Stefan Seifert, Dagmar Triebel, Tanja Weibulat (SNSB IT Center, DiversityDescriptions, SDD Data-Pipelines für GFBio, DEEMY)

Protokoll: Tanja Weibulat

Thema

Anhand von publizierten funktionellen und phylogenetischen Trait-Daten (nach EML bzw. SDD strukturiert und als csv oder xml verfügbar) soll die informationstechnische Seite der Visualisierung und Analyse derartiger Datenquellen besprochen werden.

Wegen Terminüberschneidungen organisiert Frau Gerstner ein zweites Treffen in München am 11.7., dann mit Robert Huber und Entwicklern in München.

Sie stellt aber trotzdem Material und Vortrag zu EML für den 7.7. bereit.

Agenda

  • ab 10.30 Uhr Eintreffen der Teilnehmer
  • 11.00 Begrüßung (D. Triebel)
  • 11.05 Uhr Demo des GFBio VAT Tools, mögliche Interoperabilität mit SDD und EML (M. Mattig, B. Seeger)
  • 11.45 Uhr Demo von DEEMY Portal mit NaviKey Applet zur Merkmalsauswahl und interaktiven Identifikation (G. Rambold, D. Triebel)
  • 12.00 Uhr DEEMY und BEF China, Beispiele für Datenmanagement in DiversityDescriptions (V. Sanz)
  • 12.15 Uhr Demo von LIAS gtm, Daten-Export als csv, Erörterung einer möglichen Datenbereitstellung der Exporte für das GFBio VAT Tool (G. Rambold)
  • 12.45 Uhr Mittagspause, Café Botanischer Garten
  • 13.30 Uhr Datenmanagement mit DiversityDescriptions, Pipelines zum Datenimport z. B. als csv, und Datenexport, Datenpublikation, SDD xml-Archive im GFBio Wiki (DEEMY html, SDD-structured xml, DELTA) (V. Sanz)
  • 14.00 Uhr Community Standard SDD und Community Standard EML (D. Triebel)
  • 14.15 Uhr Datenmanagement ökologischer Datenpakete mit Morpho; Datenbereitstellung als EML für GFBio VAT Tool mit MetaCat über SGN Webserver (T. Weibulat in Vertretung von E.-M. Gerstner)
  • 14.45 Uhr Diskussion über Möglichkeiten der Datenbereitstellung für GFBio VAT Tool über Daten-Pipelines aus DiversityProjects + DiversityDescriptions-Installationen; GFBio Datenpakete mit GFBio Submission Meta-Information nach ?? ABCD oder ?? EML oder ?? SDD-Standard als xml-Archive angeboten über SNSB Webserver? Welche Meta-Informationen braucht das VAT Tool?
  • 15.15 Uhr Kaffeepause
  • 15.45 Uhr Abschlussdiskussion und angestrebte Kooperationen, inkl. Diskussion über SDD-EML-OAI-PMH Mapping und Conversion Tools? ToDos - GFBio Phase III?
  • 16.30 Uhr Ende


Links

References

  • Authmann C., Beilschmidt C., Drönner J., Mattig M. & Seeger B. (2015). VAT: A System for Visualizing, Analyzing and Transforming Spatial Data in Science. Datenbank-Spektrum 15(3): 175-184 (doi:10.1007/s13222-015-0197-y)
  • Rambold, G., Zedda, L., Coyle, J., Peršoh, D., Köhler, T., Triebel, D. (2016). Geographic heat maps of lichen traits derived by combining LIAS light description and GBIF occurrence data, provided on a new platform. – Biodiversity and Conservation 25(13): 2743–2751. (doi:10.1007/s10531-016-1199-2)



Treffen zur Vorbereitung der Nomenclature Section, Shenzhen, China, August 2017

siehe auch IAPT unter http://www.iapt-taxon.org/pages/nomenclature

21.6.2017, 11.00 Uhr


Teilnehmer: Andreas Beck, Konstanze Bensch, Hajo Esser, Andreas Fleischmann, Marc Gottschling, Susanne Renner


TOP 1. Überblick Proposal, online-Informationsquellen zu Proposals und Entscheidungshilfen/ Empfehlungen der Committees

  • Synopsis of Proposals on Nomenclature – Shenzhen 2017: Datei liegt vor, Markierungen durch K. Bensch


  • A review of the proposals concerning the International Code of Nomenclature for algae, fungi, and plants submitted to the XIX International Botanical Congress:

http://www.ingentaconnect.com/contentone/iapt/tax/2017/00000066/00000001/art00037


TOP 2. Reports


TOP 3. Proposals to change the code

  • Allgemeine Proposals (Datei: other proposals to vote on). Datei liegt vor.
  • Proposals related to fungi . Datei liegt vor, grüne Markierungen durch K. Bensch.


TOP 4. Proposals zu Appendices

  • Proposals to conserve or reject fungal names Datei liegt vor, zusammengestellt durch K. Bensch, NCF hat mit nein gestimmt.
  • Proposals to conserve or reject plant names
  • Proposals to conserve or reject names of other groups


Anmerkungen zur Materialsammlung von K. Bensch hinsichtlich allgemeines Vorgehen und NCF: 
*In der Datei „Synopsis of Proposals...“ habe ich die, über die wir vielleicht sprechen sollten markiert.
*In der Datei „proposals to change the code fungi for IBC” habe ich die Proposals, über die wir sprechen sollten, grün markiert. Diese betreffen allgemeine Änderungen im Wortlaut des Codes.
*In einer zweiten Datei „Proposals to conserve or reject fungal names“ habe ich die Proposal zusammengestellt, bei denen das NCF mehrheitlich mit nein gestimmt hat.
*Alle anderen Proposals, zusammengestellt in Report 20, wurden akzeptiert.













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