DiversityNaviKey - Revision history

Triebel at 06:55, 7 September 2023

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Triebel at 06:41, 7 September 2023

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Triebel at 06:19, 7 September 2023

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Triebel at 06:19, 7 September 2023

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Triebel at 06:16, 7 September 2023

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Triebel at 08:10, 10 July 2021

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Triebel: Created page with "email Ariane, 9.7.21: Das Problem ist, wenn der Link https://services.snsb.info/divnavikey/ sich jetzt 'verbreitet', wissen wir gar nicht mehr, wer da alles auf unserer Testum..."

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Created page with "email Ariane, 9.7.21: Das Problem ist, wenn der Link https://services.snsb.info/divnavikey/ sich jetzt 'verbreitet', wissen wir gar nicht mehr, wer da alles auf unserer Testum..."

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email Ariane, 9.7.21: Das Problem ist, wenn der Link https://services.snsb.info/divnavikey/ sich jetzt 'verbreitet', wissen wir gar nicht mehr, wer da alles auf unserer Testumgebung ist. Die Reviewer wissen ja nicht mal das das eigentlich eine interne Testumgebung ist und nicht weitergegeben werden soll. Abgesehen davon, dass die Umgebung nicht unbedingt immer funktioniert, sehe ich da auch andere Probleme. Wir können dann in Zukunft eigentlich nicht anbieten, dass jemand seine Daten schonmal vorab auf der Testumgebung anschauen kann, wenn diese z.B. noch nicht öffentlich sein sollen, oder irgendwie gerade noch nicht passen. Wenn jemand jetzt die Testumgebung als 'App' installiert, sieht er auch alle zukünftigen Daten.

https://github.com/tdwg/mids/blob/working-draft/current-draft/MIDS-definition-v0.14-29Mar2021.md#9-conformance-normative

https://discourse.gbif.org/t/converging-digital-specimens-and-extended-specimens-towards-a-global-specification-for-data-integration-phase-1/2394

DiversityNaviKey Description: [[DiversityNaviKey]] bzw. https://diversityworkbench.net/Portal/DiversityNaviKey

DiversityNaviKey Productive: https://divnavikey.snsb.info

DiversityNaviKey User Test: https://services.snsb.info/divnavikey/

DiversityNaviKey Developer Test: https://services.snsb.info/divnavikeytest/

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	The new application is realised as a „Progressive Web Application (PWA)“. Thus, it is platform independent and is running on every common browser (Firefox, Chrome, Edge, Safari). The pages are responsive and adjusted to the user device (desktop, tablet, smartphone). On smartphones it looks like a native app. By using caching mechanism of modern browsers, like ServiceWorker and IndexedDB, the main tasks of the application will also be available in offline mode. The access to the tool might be organised as part of existing web portals and information systems.		The new application is realised as a „Progressive Web Application (PWA)“. Thus, it is platform independent and is running on every common browser (Firefox, Chrome, Edge, Safari). The pages are responsive and adjusted to the user device (desktop, tablet, smartphone). On smartphones it looks like a native app. By using caching mechanism of modern browsers, like ServiceWorker and IndexedDB, the main tasks of the application will also be available in offline mode. The access to the tool might be organised as part of existing web portals and information systems.

−	DiversityNaviKey is using SDD structured data sources offered via PostgreSQL cache database mechanisms and REST web services as established for [[DiversityDescriptions]]. It is the reimplementation of the well-known multi-lingual java applet/application [http://navikey.net NaviKey] which is also an integrated part of the [http://www.diversitynavigator.net/ DiversityNavigator] database client.	+	DiversityNaviKey is using SDD structured data sources offered via PostgreSQL cache database mechanisms and REST web services as established for [https://diversityworkbench.net/Portal/DiversityDescriptions DiversityDescriptions]. It is the reimplementation of the well-known multi-lingual java applet/application [http://navikey.net NaviKey] which is also an integrated part of the [http://www.diversitynavigator.net/ DiversityNavigator] database client.

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	For current software releases see '''https://divnavikey.snsb.info'''.		For current software releases see '''https://divnavikey.snsb.info'''.

−	Code Repository: https://github.com/SNSB/~~DiversityNaviKe~~	+	Code Repository: https://github.com/SNSB/DiversityNaviKey
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		+	DiversityNaviKey was presented 2021
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		+	*at the [https://informatik2021.gi.de/informatik2021 INFORMATIK 21 Konferenz Berlin & online], Workshop [https://www.nfdi4biodiversity.org/cs4biodiversity/ Computer Science for Biodiversity] with DNK presentation [https://www.nfdi4biodiversity.org/documents/5/CS4BioDiversity_Talk_DiversityNaviKey_ArianeGrunz.pdf here] and abstracts [https://informatik2021.gi.de/informatik2021/workshops/cs4biodiversity here].
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		+	*at the [https://www.snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/Wiki.jsp?page=DivWorkbenchWorkshop_42 42. Diversity Workbench Workshop].
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		+	See also paper:
		+
		+	*Triebel, D., Grunz, A., Seifert, S., Link, A. & Rambold, G., (2021). DiversityNaviKey, a Progressive Web Application for interactive diagnosis and identification. In: , . (Hrsg.), INFORMATIK 2021. Gesellschaft für Informatik, Bonn. (S. 517-538). [https://dl.gi.de/handle/20.500.12116/37705 DOI: 10.18420/informatik2021-040]
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		+	SNSB Press release 2022: [https://snsb.de/diversitynavikey/ SNSB entwickelt neue Diagnose-App für Forschung und Sammlungen] with English version [https://snsb.de/diversitynavikey/?lang=en SNSB develops new diagnostic app for natural science objects]
		+	----
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		+	==Data sources ==
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		+	Currently six data sources are open and freely available for diagnosis and identification purposes with use of DiversityNaviKey and data access via the [https://www.snsb.info SNSB IT Center]. They are from different scientific fields (botany, mycology, lichenology, bacteriology, chemistry, sociology). The by far largest dataset is that on lichen trait data provided by the long-term information system [http://www.lias.net/ LIAS].
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		+	The table under [[DWB DiversityNaviKey data sources]] describes the single datasets.
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		+	----
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		+	Future extension to cover [https://diversityworkbench.net/Portal/DiversityMobile DiversityMobile] functions is envisaged. DiversityNaviKey might also become part of the wider [https://www.nfdi4biodiversity.org/ NFDI4Biodiversity] RDC cloud tool network.
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		+	Back to [[DWB DiversityNaviKey data sources]]

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	For current software releases see '''https://divnavikey.snsb.info'''.		For current software releases see '''https://divnavikey.snsb.info'''.

−	Code Repository: https://github.com/SNSB/~~DiversityNaviKey~~	+	Code Repository: https://github.com/SNSB/DiversityNaviKe
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−	~~DiversityNaviKey was presented 2021~~
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−	*at the [https://informatik2021.gi.de/informatik2021 INFORMATIK 21 Konferenz Berlin & online], Workshop [https://www.nfdi4biodiversity.org/cs4biodiversity/ Computer Science for Biodiversity] with DNK presentation [https://www.nfdi4biodiversity.org/documents/5/CS4BioDiversity_Talk_DiversityNaviKey_ArianeGrunz.pdf here] and abstracts [https://informatik2021.gi.de/informatik2021/workshops/cs4biodiversity here].
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−	*at the [https://www.snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/Wiki.jsp?page=DivWorkbenchWorkshop_42 42. Diversity Workbench Workshop].
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−	~~See also paper:~~
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−	*Triebel, D., Grunz, A., Seifert, S., Link, A. & Rambold, G., (2021). DiversityNaviKey, a Progressive Web Application for interactive diagnosis and identification. In: , . (Hrsg.), INFORMATIK 2021. Gesellschaft für Informatik, Bonn. (S. 517-538). [https://dl.gi.de/handle/20.500.12116/37705 DOI: 10.18420/informatik2021-040]
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−	SNSB Press release 2022: [https://snsb.de/diversitynavikey/ SNSB entwickelt neue Diagnose-App für Forschung und Sammlungen] with English version [https://snsb.de/diversitynavikey/?lang=en SNSB develops new diagnostic app for natural science objects]
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−	~~==Data sources ==~~
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−	Currently six data sources are open and freely available for diagnosis and identification purposes with use of DiversityNaviKey and data access via the [https://www.snsb.info SNSB IT Center]. They are from different scientific fields (botany, mycology, lichenology, bacteriology, chemistry, sociology). The by far largest dataset is that on lichen trait data provided by the long-term information system [http://www.lias.net/ LIAS].
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−	~~The table under [[DWB DiversityNaviKey data sources]] describes the single datasets.~~
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−	Future extension to cover [https://diversityworkbench.net/Portal/DiversityMobile DiversityMobile] functions is envisaged. DiversityNaviKey might also become part of the wider [https://www.nfdi4biodiversity.org/ NFDI4Biodiversity] RDC cloud tool network.
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−	email Ariane, 9.7.21: Das Problem ist, wenn der Link https://services.snsb.info/divnavikey/ sich jetzt 'verbreitet', wissen wir gar nicht mehr, wer da alles auf unserer Testumgebung ist. Die Reviewer wissen ja nicht mal das das eigentlich eine interne Testumgebung ist und nicht weitergegeben werden soll. Abgesehen davon, dass die Umgebung nicht unbedingt immer funktioniert, sehe ich da auch andere Probleme. Wir können dann in Zukunft eigentlich nicht anbieten, dass jemand seine Daten schonmal vorab auf der Testumgebung anschauen kann, wenn diese z.B. noch nicht öffentlich sein sollen, oder irgendwie gerade noch nicht passen. Wenn jemand jetzt die Testumgebung als 'App' installiert, sieht er auch alle zukünftigen Daten.
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−	~~https://github.com/tdwg/mids/blob/working-draft/current-draft/MIDS-definition-v0.14-29Mar2021.md#9-conformance-normative~~
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−	~~https://discourse.gbif.org/t/converging-digital-specimens-and-extended-specimens-towards-a-global-specification-for-data-integration-phase-1/2394~~
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−	~~DiversityNaviKey Description: [[DiversityNaviKey]] bzw. https://diversityworkbench.net/Portal/DiversityNaviKey~~
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−	~~DiversityNaviKey Productive: https://divnavikey.snsb.info~~
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−	~~DiversityNaviKey User Test: https://services.snsb.info/divnavikey/~~
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−	~~DiversityNaviKey Developer Test: https://services.snsb.info/divnavikeytest/~~
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−	~~Abouts und Texte sowie links/ Reference unter aufzubauen und inhaltlich zu pflegen~~
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−	~~Einstiegsseite bliebt: https://diversityworkbench.net/Portal/DiversityNaviKey~~
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−	~~danach Erklärungen und Verlinkungen unter~~
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−	~~http://www.deemy.de/ --> NaviKey~~
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−	~~http://liaslight.lias.net/ --> NaviKey~~
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−	~~http://liaslight.lias.net/Identification/Navikey/Metabolites/index.html~~
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−	~~https://data.snsb.info/dataset/gfbio/projects_gfbio/967/?archiveid=5~~
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−	~~https://data.snsb.info/dataset/gfbio/projects_gfbio/968/?archiveid=20~~
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−	~~https://wiki.bayernflora.de/web/Quiz und/ oder http://artenquiz.bayernflora.de/ bzw.~~
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−	vielleicht ist auch (parallel dazu) eine Darstellung wie http://www.snsb.info/dwb_biocase.html sinnvoll mit link zu SNSB Wiki, siehe http://www.snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/Wiki.jsp?page=BioCASeWrapperSNSB oder DWB Wiki https://diversityworkbench.net/Portal/DiversityNaviKey
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−	~~----~~
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−	Info zur zweiten Testumgebung: Auf der testen Ariane, Toni und Stefan bevor das auf die obere Testumgebung geht, d.h. die sollte wirklich nur intern verwendet werden. Da schreibe ich keine Emails usw. wenn ich was ändere, auch werden da demnächst andere DBs angezeigt, die Toni, Stefan und ich zum Testen verwenden. Kann auch passieren das diese Testumgebung ab und an nicht richtig geht.

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		+	The software application DiversityNaviKey (DNK) is a generic tool primarily designed for any kind of diagnosis and interactive identification of organisms or other items as well as item groups which are part of or related to biodiversity, geodiversity or environmental research, by means of a set of pre-defined characteristics. It allows for sophisticated selection based on highly structured data sources (datasets) with descriptive data (trait data with descriptors, descriptor categorical states, descriptor values). The browser-based tool is optimized to build and run determination keys based on the consecutive selection of descriptors, descriptor states and values during the identification process. Selection criteria might be predefined by individual user or changed during the identification process.
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		+	The new application is realised as a „Progressive Web Application (PWA)“. Thus, it is platform independent and is running on every common browser (Firefox, Chrome, Edge, Safari). The pages are responsive and adjusted to the user device (desktop, tablet, smartphone). On smartphones it looks like a native app. By using caching mechanism of modern browsers, like ServiceWorker and IndexedDB, the main tasks of the application will also be available in offline mode. The access to the tool might be organised as part of existing web portals and information systems.
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		+	DiversityNaviKey is using SDD structured data sources offered via PostgreSQL cache database mechanisms and REST web services as established for [[DiversityDescriptions]]. It is the reimplementation of the well-known multi-lingual java applet/application [http://navikey.net NaviKey] which is also an integrated part of the [http://www.diversitynavigator.net/ DiversityNavigator] database client.
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		+	For current software releases see '''https://divnavikey.snsb.info'''.
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		+	Code Repository: https://github.com/SNSB/DiversityNaviKey
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		+	DiversityNaviKey was presented 2021
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		+	*at the [https://informatik2021.gi.de/informatik2021 INFORMATIK 21 Konferenz Berlin & online], Workshop [https://www.nfdi4biodiversity.org/cs4biodiversity/ Computer Science for Biodiversity] with DNK presentation [https://www.nfdi4biodiversity.org/documents/5/CS4BioDiversity_Talk_DiversityNaviKey_ArianeGrunz.pdf here] and abstracts [https://informatik2021.gi.de/informatik2021/workshops/cs4biodiversity here].
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		+	*at the [https://www.snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/Wiki.jsp?page=DivWorkbenchWorkshop_42 42. Diversity Workbench Workshop].
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		+	See also paper:
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		+	*Triebel, D., Grunz, A., Seifert, S., Link, A. & Rambold, G., (2021). DiversityNaviKey, a Progressive Web Application for interactive diagnosis and identification. In: , . (Hrsg.), INFORMATIK 2021. Gesellschaft für Informatik, Bonn. (S. 517-538). [https://dl.gi.de/handle/20.500.12116/37705 DOI: 10.18420/informatik2021-040]
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		+	SNSB Press release 2022: [https://snsb.de/diversitynavikey/ SNSB entwickelt neue Diagnose-App für Forschung und Sammlungen] with English version [https://snsb.de/diversitynavikey/?lang=en SNSB develops new diagnostic app for natural science objects]
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		+	==Data sources ==
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		+	Currently six data sources are open and freely available for diagnosis and identification purposes with use of DiversityNaviKey and data access via the [https://www.snsb.info SNSB IT Center]. They are from different scientific fields (botany, mycology, lichenology, bacteriology, chemistry, sociology). The by far largest dataset is that on lichen trait data provided by the long-term information system [http://www.lias.net/ LIAS].
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		+	The table under [[DWB DiversityNaviKey data sources]] describes the single datasets.
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		+	Future extension to cover [https://diversityworkbench.net/Portal/DiversityMobile DiversityMobile] functions is envisaged. DiversityNaviKey might also become part of the wider [https://www.nfdi4biodiversity.org/ NFDI4Biodiversity] RDC cloud tool network.
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		+	Back to [[DWB DiversityNaviKey data sources]]
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	email Ariane, 9.7.21: Das Problem ist, wenn der Link https://services.snsb.info/divnavikey/ sich jetzt 'verbreitet', wissen wir gar nicht mehr, wer da alles auf unserer Testumgebung ist. Die Reviewer wissen ja nicht mal das das eigentlich eine interne Testumgebung ist und nicht weitergegeben werden soll. Abgesehen davon, dass die Umgebung nicht unbedingt immer funktioniert, sehe ich da auch andere Probleme. Wir können dann in Zukunft eigentlich nicht anbieten, dass jemand seine Daten schonmal vorab auf der Testumgebung anschauen kann, wenn diese z.B. noch nicht öffentlich sein sollen, oder irgendwie gerade noch nicht passen. Wenn jemand jetzt die Testumgebung als 'App' installiert, sieht er auch alle zukünftigen Daten.		email Ariane, 9.7.21: Das Problem ist, wenn der Link https://services.snsb.info/divnavikey/ sich jetzt 'verbreitet', wissen wir gar nicht mehr, wer da alles auf unserer Testumgebung ist. Die Reviewer wissen ja nicht mal das das eigentlich eine interne Testumgebung ist und nicht weitergegeben werden soll. Abgesehen davon, dass die Umgebung nicht unbedingt immer funktioniert, sehe ich da auch andere Probleme. Wir können dann in Zukunft eigentlich nicht anbieten, dass jemand seine Daten schonmal vorab auf der Testumgebung anschauen kann, wenn diese z.B. noch nicht öffentlich sein sollen, oder irgendwie gerade noch nicht passen. Wenn jemand jetzt die Testumgebung als 'App' installiert, sieht er auch alle zukünftigen Daten.

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	DiversityNaviKey Developer Test: https://services.snsb.info/divnavikeytest/		DiversityNaviKey Developer Test: https://services.snsb.info/divnavikeytest/
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		+	Abouts und Texte sowie links/ Reference unter aufzubauen und inhaltlich zu pflegen
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		+	Einstiegsseite bliebt: https://diversityworkbench.net/Portal/DiversityNaviKey
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		+	danach Erklärungen und Verlinkungen unter
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		+	http://www.deemy.de/ --> NaviKey
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		+	http://liaslight.lias.net/ --> NaviKey
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		+	http://liaslight.lias.net/Identification/Navikey/Metabolites/index.html
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		+	https://data.snsb.info/dataset/gfbio/projects_gfbio/968/?archiveid=20
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		+	https://wiki.bayernflora.de/web/Quiz und/ oder http://artenquiz.bayernflora.de/ bzw.
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		+	vielleicht ist auch (parallel dazu) eine Darstellung wie http://www.snsb.info/dwb_biocase.html sinnvoll mit link zu SNSB Wiki, siehe http://www.snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/Wiki.jsp?page=BioCASeWrapperSNSB oder DWB Wiki https://diversityworkbench.net/Portal/DiversityNaviKey
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		+	Info zur zweiten Testumgebung: Auf der testen Ariane, Toni und Stefan bevor das auf die obere Testumgebung geht, d.h. die sollte wirklich nur intern verwendet werden. Da schreibe ich keine Emails usw. wenn ich was ändere, auch werden da demnächst andere DBs angezeigt, die Toni, Stefan und ich zum Testen verwenden. Kann auch passieren das diese Testumgebung ab und an nicht richtig geht.

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	email Ariane, 9.7.21: Das Problem ist, wenn der Link https://services.snsb.info/divnavikey/ sich jetzt 'verbreitet', wissen wir gar nicht mehr, wer da alles auf unserer Testumgebung ist. Die Reviewer wissen ja nicht mal das das eigentlich eine interne Testumgebung ist und nicht weitergegeben werden soll. Abgesehen davon, dass die Umgebung nicht unbedingt immer funktioniert, sehe ich da auch andere Probleme. Wir können dann in Zukunft eigentlich nicht anbieten, dass jemand seine Daten schonmal vorab auf der Testumgebung anschauen kann, wenn diese z.B. noch nicht öffentlich sein sollen, oder irgendwie gerade noch nicht passen. Wenn jemand jetzt die Testumgebung als 'App' installiert, sieht er auch alle zukünftigen Daten.		email Ariane, 9.7.21: Das Problem ist, wenn der Link https://services.snsb.info/divnavikey/ sich jetzt 'verbreitet', wissen wir gar nicht mehr, wer da alles auf unserer Testumgebung ist. Die Reviewer wissen ja nicht mal das das eigentlich eine interne Testumgebung ist und nicht weitergegeben werden soll. Abgesehen davon, dass die Umgebung nicht unbedingt immer funktioniert, sehe ich da auch andere Probleme. Wir können dann in Zukunft eigentlich nicht anbieten, dass jemand seine Daten schonmal vorab auf der Testumgebung anschauen kann, wenn diese z.B. noch nicht öffentlich sein sollen, oder irgendwie gerade noch nicht passen. Wenn jemand jetzt die Testumgebung als 'App' installiert, sieht er auch alle zukünftigen Daten.