Agenda
am besten neue Wiki-Seite unter http://zsm-entomology.de/wiki/ anlegen
nach Absatz "Specimen data" neuen Absatz "Drawer digitization with DWB data management" anlegen
dort dann neue Seite mit Seitennamen: [Meeting-2017-05-03]
Inhalt dieser Seite dorthin kopieren.
Treffen zum Thema Kastendigitalisierung mit Datenmanagement in der Diversity Workbench, Identifiers
Zeit: 2017-05-03, 10.30 Uhr bis 12.00 Uhr
Teilnehmer Veronica Sanz, Stefan Schmidt, Stefan Seifert, Dagmar Triebel, Tanja Weibulat, Markus Weiss
Ort: SNSB IT-Zentrum
Protokoll
TOP 1. ZSM-Projekt: Kastendigitalisierung und Identifiers
Struktur:
Es gibt Kästen -> angelegt im Bereich Collection
Darin die Kastenbereiche (z.B. Artenblöcke) -> angelegt im Bereich Collection
Je Kastenbereich virtuelle Specimen-Gruppen (in der Kombination Art + Geographie; diese Gruppierungen sind jedoch nicht sichtbar, da innerhalb der Kastenbereiche (z.B. Artenblöcke, die einzelnen Individuen nicht geordnet sind) -> angelegt als einzelne Specimens
Manchmal werden noch einzelne Specimens aufgenommen, z. B. Typusexemplare, -> angelegt als einzelne Specimens
Specimen-Gruppen und Specimens werden für wissenschaftliche Portale prozessiert.
Bilder:
Es gibt Bild von dem Kasten -> wird diesem sowie den Specimen-Gruppen zugeordnet.
Es gibt Bild von dem Kastenbereich -> wird diesem sowie den Specimen-Gruppen zugeordnet.
Es gibt keine Bilder von den Specimen-Gruppen.
Es gibt Bilder der einzelnen Specimens, die den einzelnen Specimens zugeordnet werden.
GUIDs:
(Entomologie-Sammlungsdaten sind noch nicht über diese BioCASe-Services verfügbar; die GUIDs sind daher noch nicht aktiv)
- GUID auf Dataset-Ebene: http://id.snsb.info/zsm/projects_zsm/927
- GUID auf Unit-Ebene für Beobachtungsdaten (Bsp. HYMIScoll): http://id.snsb.info/zsm/collection_zsm/558655/624852
- GUID auf Unit-Ebene für Sammlungsdaten (Bsp. ZSMhymenopteracoll, Specimens und Specimen-Gruppen): http://id.snsb.info/zsm/collection_zsm/557696/623552/515493
- GUID auf Kasten-Ebene und auf Ebene der Kastenbereiche, also für alles was in Datenbank-Tabelle "Collection" eingetragen wird: http://id.snsb.info/zsm/collection_zsm/collection/12345 (wird derzeit nicht zur Publikation über BioCASe vorgesehen, da Inhalte bezogen auf Einzelobjekte/ Specimens/ Specimen-Gruppen) nicht stabil; Versionierung nötig)
Akzessionsnummern:
QR-Codes sollen nur die Acc.Nr. enthalten, nicht den ganzen Link. Sie werden auf zwei Ebenen geklebt: Auf den Kasten plus evtl. bei einzelnen Individuen.
- ZSM-HD-0000001 (HymenopteraDrawer) (bei den Kästen 7-stellig)
- ZSM-LD-0000001 (LepidopteraDrawer)
- ZSM-CD-0000001 (ColeopteraDrawer)
- ZSM-HYM-123456 (einzelnes Hymenoptera-Specimen) (exakte Nummernlänge momentan noch unbekannt, 6 oder 7-stellig vorgesehen)
Die Nummern für Kastenbereiche und Specimen-Gruppen sind rein virtuell, d. h. es gibt keine ausgedruckten Etiketten:
- Kastenbereiche (z. B. Artenblöcke): ZSM-ID-CollectionID (hier sollte evtl. noch anstatt ID etwas anderes verwendet werde (CID - CollectionID?), um identische Nummern mit Specimen-Gruppen zu vermeiden)
- Specimen-Gruppen: ZSM-ID-SpecimenID
Accession-Number Lookup Service (ANLS):
It is a Re-direct Service to landingpages in the BioCASe-Provider Tool installation at SNSB ("id_service") and is an additional convenience service.
Search for already published accession numbers:
http://id.snsb.info/object/<Accession-Number>
Beispiele aus ZSM:
Beispiele aus anderen Sammlungen der SNSB:
siehe auch unter http://cetaf.org/cetaf-stable-identifiers
Da stimmen die Einträge für die SNSB nicht mehr.
Zusätzliche Informationen:
Die Information, dass es sich um die Sammlung Wolfsberger handelt, sollte vielleicht in das Feld "Depositor"? Die information, dass das Einzel-Specimen vor dem Sterbetag von Wolfsberger gesammelt wurde, schreibt man vielleicht am besten in das Feld "Date Suppl", d. h. "before 19xx".
TOP 2. DTN Projekt Hymenoptera GBOL Taxonliste mit Rote Liste Deutschland 2009ff Information
Kann an GBIF angebunden werden.
http://www.gbif.org/installation/1a540a73-a60d-4816-bff6-b1ac74b598c9
Sonstiges
2 Vorträge bei CETAF
- Grafik zur Datenpipeline (ppt 8) in http://species-id.net/o/media/0/04/ISTC_2017_Triebel_GFBio.pdf
- GUIDs und andere IDs werden in DiversityProjects_ZSM und DiversityCollection_ZSM verwaltet, zusammen mit zusätzlichen internen und externen IDs (z.B. BOLD BINs)